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Acceso para coordinadores

Laboratorio de Genómica Microbiana

Laboratorio de Genómica Microbiana

 

Integrantes

  • Dr. Bruno Gómez Gil Rodríguez Sala, SNI nivel 2, Responsable.
  • M. en C. Karen Enciso Ibarra, técnico analista
  • MIBA Alejandra Sarahí Díaz Sánchez, técnico analista
  • MGI Jesús Daniel Fregoso Rueda, Responsable de Gestión de la Calidad

Líneas de investigación

  • Genómica de bacterias acuáticas
  • Metagenómica de organismos y ambientes acuáticos

Líneas estratégicas

  • Genómica microbiana

Proyectos vigentes

  • Filogenia genómica de la familia Vibrionaceae de las Gamaproteobacterias.
  • Genómica comparativa de cepas deVibrio parahaemolyticus AHPND positivas.
  • Metagenómica del tracto digestivo de organismos marinos en cultivo.

Especies de estudio o modelo

  • Bacterias de la familia Vibrionaceae

Objetivos

  • Investigación básica y aplicada en genómica y metagenómica de bacterias marinas y organismos acuáticos.

Productividad

  1. Magaña-Lizárraga JA, Hernández-Peinado JV, Ahumada-Santos YP, Ricardo Parra-Unda J, Uribe-Beltrán MJ, Gómez-Gil B, Báez-Flores ME. 2017. Draft Genome Sequence of a Mexican Community-Associated MethicillinResistantStaphylococcus epidermidisStrain. Genome Announc 5:e01236-17. https://doi.org/10.1128/genomeA.01236-17.
  2. Sánchez-Díaz R, Molina-Garza Z, Cruz-Suárez E, Selvin J, Seghal Kiran G, Ibarra-Gámez J, Gomez-Gil B, Galaviz-Silva L.2017. Draft Genome Sequence of Pseudoalteromonas piscicida Strain 36Y RITHPW, an Hypersaline Seawater Isolate from the South Coast of Sonora, Mexico. Genome Announcements.
  3. Guerrero A, Lizárraga-Partida LM, Gómez Gil B, Licea-Navarro AF, Revilla-Castellanos VJ, Wong-Chang I, González-Sánchez R. 2017. Genetic Analysis of Vibrio parahaemolyticus O3:K6 Strains That Have Been Isolated in Mexico Since 1998. PLoS ONE 12(1): e0169722. doi:10.1371/ journal.pone.0169722.
  4. A.K.M. Rohul Amin, Mami Tanaka, Nurhidayu Al-saari, Gao Feng, Sayaka Mino, Yoshitoshi Ogura, Tetsuya Hayashi, Pedro M. Meirelles, Fabiano L. Thompson, Bruno Gomez-Gil, Toko Sawabe, Tomoo Sawabe. 2017. Thaumasiovibrio occultusgen. nov. sp. nov. and Thaumasiovibrio subtropicussp. nov. within the family Vibrionaceae, isolated from coral reef seawater off Ishigaki Island, Japan. Systematic and Applied Microbiology https://doi.org/10.1016/j.syapm. 2017.04.003.
  5. Eggermont Mieke, Bossier Peter, Pande Gde Sasmita Julyantoro, Delahaut Vyshal, Rayhan Ali, Gupta, Nipa, Islam Shikder Saiful, Yumo Elsie, Nevejan Nancy, Sorgeloos Patrick, Gomez-Gil Bruno, Defoirdt Tom 2017 Isolation of Vibrionaceae from wild blue mussel (Mytilus edulis) adults and their impact onblue mussel larviculture. FEMS Microbiology Ecology 93 doi:10.1093/femsec/fix039.

Infraestructura y Equipamiento

  • Dos secuenciadores masivos de nueva generación, Ion Torrent PGM e Illumina MiniSeq.
  • Fragmentador de ácidos nucleicos (bioruptor).
  • Una campana de bioseguridad y una de flujo laminar.
  • Termocicladores tiempo real (2) y punto final (3).
  • Tres servidores bioinformáticos de 12, 64 y 96 núcleos, acoplados a un servidor de almacenamiento NAS.
  • Equipo accesorio como refrigeradores (2), congeladores (1), microscopios, ultracongeladores (2), fotodocumentador, incubadora con agitación, horno de hibridación y autoclaves (2).